广西巴马壮族长寿老人p16基因甲基化(一)

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作者：期陈文成 潘尚领 覃志坚 韦叶生 何印蕾 林伟雄

【摘要】 　　目的 探讨p16基因甲基化与人类长寿的关系。 方法 应用甲基化特异性PCR（MSP）技术对巴马156例（年龄90～105岁，平均93.2岁，长寿组）健康壮族长寿老人和142例健康壮族成年人（年龄20～72岁，平均34.8岁，对照组）的p16基因甲基化状况进行分析。 结果 长寿组p16基因甲基化率(20%)明显低于对照组（39%)(P0.05）。结论 p16基因甲基化与人类长寿有着较为密切的联系。

【关键词】 p16；长寿；甲基化

　　人的寿命与环境因素和遗传因素均有很大的关系，其中恶性肿瘤是老年人易患的直接关系到寿限的疾病之一，而肿瘤的发生与机体的抑癌基因关系密切。p16基因是一种重要的抑癌基因，在细胞周期过程中扮演着非常重要的角色，p16基因缺失或突变已被证实是许多肿瘤发生的原因之一〔1〕。近年研究表明p16基因与细胞衰老有着紧密的联系。本文旨在探讨健康巴马壮族长寿老人p16基因甲基化程度，进一步揭示其与长寿的关系。

　　1 对象与方法

　　1.1 对象

　　长寿组（LG）156例，年龄90～105岁（12名≥100岁），平均年龄93.2岁，男46例，女110例。对照组（CG）142例均为健康成年人，年龄20～72岁，平均年龄34.8岁，男57例，女85例。研究对象均为居住在巴马县（主要是甲篆、凤凰、西山等乡镇）和东兰县（主要是城关、长乐、武篆、三石等乡镇）的壮族人，据家谱均可逆查8代以上。LG老人均为巴马县长寿研究所和东兰县老干局老龄办建档并长期随访的对象。CG为同一地理区域内无血缘关系、随机抽样的成年人，生活习惯及劳动条件与LG组均基本相同。每个实验对象采静脉血2 ml，加ACD抗凝，用经典的苯酚/氯仿抽提法提取白细胞DNA〔2〕。用TE溶液溶解DNA样本置4℃待用。

　　1.2 主要试剂

　　引物设计参照文献〔3〕的报道，甲基化及非甲基化引物扩增片断长度分别是150 bp和151 bp，由上海生工生物工程技术有限公司合成。 p16甲基化引物序列：上游5＇?TTATTAGAGGGTGGGGCGGATCGC?3＇；下游5＇?GAGAAGCGAGTAA?3＇，p16非甲基化引物序列：上游5＇?TTATTAGAGGGTGGGGTGGATTGT?3＇；下游5＇?CAAAAAACAAATAA?3＇。dNTPs、Taq DNA聚合酶（含10×buffer、MgCl2）、小牛血清（BSA）、二甲亚砜（DMSO）等均为华美公司产品。DNA Marker为宕生物工程有限公司产品。琼脂糖为西班牙进口，由上海Yito Enterprise 有限公司分装提供。

　　1.3 实验方法

　　按照Herman等〔4〕描述的甲基化特异性PCR（methylation specific PCR,MSP)方法,并参考文献〔5〕进行p16基因甲基化的检测,其原理是DNA双链变性解链后在亚硫酸氢钠作用下碱基C转化成U,但对于已发生甲基化的C则无此改变,据此设计两对不同引物进行PCR扩增即可检测出此差异。步骤如下：①DNA修饰。取50 μl(2 μg)经TE溶液溶解DNA样品,加入新配的3 mol/L NaOH 5.5 μl，42℃水浴30 min。加入新配的10 mmol/L氢醌30 μl和3.9 mol/L亚硫酸氢钠(Sigma公司)510 μl,加少许石蜡避光55℃水浴16 h。②DNA纯化。采用Wizard DNA纯化系统(Promega),将去针头的注射器针管固定于纯化柱上,将上述DNA与1ml纯化树脂混匀后转移至注射针管,加活塞轻推,同法用2 ml 80%异丙醇洗涤1次，14 000 r/min离心纯化柱2 min。加50 μl预热灭菌双蒸水于纯化柱(65℃),室温放置1 min,13 000 r/min离心2 min,弃纯化柱。加入5 μl新备的3 mol/L NaOH，42℃水浴15 min,加入乙酸铵(终浓度3 mol/L)、1 μl糖原(10 g/L)和三倍体积的无水乙醇，-20℃过夜。14 000 r/min 4℃离心20 min，70%乙醇洗涤,加50 μl双蒸水溶解备用。

　　1.3.1 PCR

　　反应体系为25 μl，每个反应体系分别加入上述两对引物；PCR反应条件为：94℃预变性4 min→94℃变性1 min→59.8℃退火1 min→72℃延伸1 min，进行33个循环反应。

　　1.3.2 电泳

　　基因扩增后以8 μl PCR反应产物在2%琼脂糖凝胶上电泳，电流45 mA，电压100 V，电泳载样缓冲液为1×TBE缓冲液，电泳后，在紫外光透射仪上观察，摄片并记录结果。甲基化引物扩增有150 bp条带说明该基因发生了甲基化，非甲基化引物扩增有151 bp条带则说明该基因未发生甲基化。

　　1.4 统计学处理

　　长寿组和对照组的各基因频率比较分析用χ2检验，用SPSS软件包进行分析。